Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPTFQ12830 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms