Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFCP2Q12800 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFCP2Q12800 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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