Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYCNQ0VAF6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms