Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCBP1Q09161 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCBP1Q09161 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms