Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBBP4Q09028 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBBP4Q09028 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RBBP4Q09028 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP4Q09028 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP4Q09028 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP4Q09028 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP4Q09028 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP4Q09028 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP4Q09028 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP4Q09028 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP4Q09028 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBBP4Q09028 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP4Q09028 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP4Q09028 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP4Q09028 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP4Q09028 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBBP4Q09028 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms