Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms