Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSC1Q08554 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms