Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM3Q08188 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM3Q08188 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms