Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN12Q05209 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms