Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELQ04864 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELQ04864 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELQ04864 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELQ04864 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RELQ04864 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RELQ04864 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RELQ04864 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RELQ04864 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RELQ04864 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RELQ04864 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RELQ04864 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RELQ04864 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RELQ04864 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RELQ04864 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RELQ04864 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RELQ04864 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RELQ04864 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RELQ04864 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RELQ04864 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RELQ04864 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RELQ04864 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RELQ04864 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RELQ04864 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RELQ04864 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms