Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT17Q04695 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms