Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB2Q03252 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB2Q03252 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms