Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX6A2Q02221 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COX6A2Q02221 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms