Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFAP4Q01664 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms