Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRCDQ00LT1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms