Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSF1Q00613 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms