Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TMF1P82094 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TMF1P82094 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TMF1P82094 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TMF1P82094 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TMF1P82094 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMF1P82094 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TMF1P82094 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TMF1P82094 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMF1P82094 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMF1P82094 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TMF1P82094 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMF1P82094 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMF1P82094 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TMF1P82094 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TMF1P82094 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TMF1P82094 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMF1P82094 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMF1P82094 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMF1P82094 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMF1P82094 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMF1P82094 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMF1P82094 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMF1P82094 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMF1P82094 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMF1P82094 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMF1P82094 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMF1P82094 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
TMF1P82094 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMF1P82094 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
TMF1P82094 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMF1P82094 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMF1P82094 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMF1P82094 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMF1P82094 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMF1P82094 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMF1P82094 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMF1P82094 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMF1P82094 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TMF1P82094 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TMF1P82094 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMF1P82094 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMF1P82094 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMF1P82094 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMF1P82094 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMF1P82094 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMF1P82094 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMF1P82094 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TMF1P82094 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TMF1P82094 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TMF1P82094 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TMF1P82094 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMF1P82094 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMF1P82094 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TMF1P82094 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TMF1P82094 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TMF1P82094 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMF1P82094 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMF1P82094 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 452.2 ms