Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUCB2P80303 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms