Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFI35P80217 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFI35P80217 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFI35P80217 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFI35P80217 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IFI35P80217 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFI35P80217 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFI35P80217 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFI35P80217 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFI35P80217 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFI35P80217 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFI35P80217 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFI35P80217 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFI35P80217 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFI35P80217 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFI35P80217 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFI35P80217 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFI35P80217 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFI35P80217 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFI35P80217 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFI35P80217 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IFI35P80217 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFI35P80217 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFI35P80217 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFI35P80217 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFI35P80217 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFI35P80217 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFI35P80217 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFI35P80217 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFI35P80217 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFI35P80217 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFI35P80217 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFI35P80217 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFI35P80217 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFI35P80217 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFI35P80217 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFI35P80217 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFI35P80217 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFI35P80217 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFI35P80217 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFI35P80217 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFI35P80217 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFI35P80217 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFI35P80217 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFI35P80217 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFI35P80217 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFI35P80217 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFI35P80217 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFI35P80217 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFI35P80217 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFI35P80217 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFI35P80217 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFI35P80217 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFI35P80217 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFI35P80217 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFI35P80217 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFI35P80217 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFI35P80217 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFI35P80217 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFI35P80217 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFI35P80217 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFI35P80217 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFI35P80217 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFI35P80217 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFI35P80217 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFI35P80217 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFI35P80217 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFI35P80217 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFI35P80217 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFI35P80217 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms