Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO1P63165 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms