Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPD3P62318 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms