Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPZ1P61923 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms