Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms