Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LOXL3P58215 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms