Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL4CP56559 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4CP56559 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4CP56559 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4CP56559 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4CP56559 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4CP56559 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL4CP56559 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL4CP56559 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms