Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTBP2P56545 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTBP2P56545 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTBP2P56545 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTBP2P56545 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTBP2P56545 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTBP2P56545 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTBP2P56545 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTBP2P56545 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTBP2P56545 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms