Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1P56182 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1P56182 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1P56182 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP1P56182 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP1P56182 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP1P56182 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP1P56182 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP1P56182 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP1P56182 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP1P56182 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP1P56182 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP1P56182 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP1P56182 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP1P56182 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP1P56182 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP1P56182 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP1P56182 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP1P56182 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP1P56182 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP1P56182 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRP1P56182 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRP1P56182 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRP1P56182 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRP1P56182 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRP1P56182 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRP1P56182 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRP1P56182 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRP1P56182 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRP1P56182 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRP1P56182 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRP1P56182 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RRP1P56182 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRP1P56182 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRP1P56182 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRP1P56182 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRP1P56182 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RRP1P56182 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RRP1P56182 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRP1P56182 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRP1P56182 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRP1P56182 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRP1P56182 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRP1P56182 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRP1P56182 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRP1P56182 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRP1P56182 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRP1P56182 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRP1P56182 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRP1P56182 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRP1P56182 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRP1P56182 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP1P56182 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP1P56182 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP1P56182 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP1P56182 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP1P56182 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP1P56182 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP1P56182 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP1P56182 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRP1P56182 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRP1P56182 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRP1P56182 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRP1P56182 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP1P56182 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP1P56182 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP1P56182 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP1P56182 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP1P56182 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP1P56182 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP1P56182 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP1P56182 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP1P56182 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP1P56182 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP1P56182 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP1P56182 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP1P56182 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP1P56182 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP1P56182 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP1P56182 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP1P56182 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP1P56182 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP1P56182 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP1P56182 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP1P56182 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP1P56182 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP1P56182 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP1P56182 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms