Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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