Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF10P55107 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF10P55107 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF10P55107 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF10P55107 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF10P55107 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF10P55107 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF10P55107 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF10P55107 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF10P55107 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF10P55107 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF10P55107 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF10P55107 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF10P55107 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF10P55107 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF10P55107 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF10P55107 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF10P55107 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF10P55107 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF10P55107 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF10P55107 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF10P55107 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF10P55107 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF10P55107 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF10P55107 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF10P55107 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF10P55107 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF10P55107 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF10P55107 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF10P55107 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF10P55107 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF10P55107 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF10P55107 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF10P55107 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF10P55107 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF10P55107 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF10P55107 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF10P55107 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF10P55107 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF10P55107 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF10P55107 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF10P55107 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF10P55107 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF10P55107 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF10P55107 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF10P55107 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF10P55107 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms