Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1P52655 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms