Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLCSP50747 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLCSP50747 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLCSP50747 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLCSP50747 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLCSP50747 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLCSP50747 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLCSP50747 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLCSP50747 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HLCSP50747 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLCSP50747 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLCSP50747 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLCSP50747 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLCSP50747 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLCSP50747 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLCSP50747 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLCSP50747 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLCSP50747 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLCSP50747 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLCSP50747 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLCSP50747 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLCSP50747 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLCSP50747 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLCSP50747 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLCSP50747 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLCSP50747 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLCSP50747 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HLCSP50747 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLCSP50747 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLCSP50747 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLCSP50747 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLCSP50747 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLCSP50747 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLCSP50747 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLCSP50747 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLCSP50747 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLCSP50747 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLCSP50747 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLCSP50747 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLCSP50747 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLCSP50747 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLCSP50747 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLCSP50747 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLCSP50747 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLCSP50747 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HLCSP50747 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLCSP50747 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLCSP50747 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLCSP50747 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLCSP50747 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HLCSP50747 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLCSP50747 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLCSP50747 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms