Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB3P49720 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms