Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCLMP48507 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLMP48507 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLMP48507 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLMP48507 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLMP48507 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLMP48507 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLMP48507 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLMP48507 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCLMP48507 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLMP48507 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLMP48507 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLMP48507 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLMP48507 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCLMP48507 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLMP48507 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLMP48507 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLMP48507 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLMP48507 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLMP48507 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLMP48507 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLMP48507 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCLMP48507 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCLMP48507 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLMP48507 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLMP48507 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLMP48507 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLMP48507 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLMP48507 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLMP48507 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLMP48507 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLMP48507 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCLMP48507 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLMP48507 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLMP48507 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLMP48507 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLMP48507 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLMP48507 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLMP48507 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLMP48507 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCLMP48507 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLMP48507 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLMP48507 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLMP48507 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLMP48507 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLMP48507 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCLMP48507 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCLMP48507 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLMP48507 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLMP48507 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLMP48507 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLMP48507 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLMP48507 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLMP48507 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLMP48507 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms