Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR4A2P43354 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR4A2P43354 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms