Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A1P43005 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms