Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAA2P42765 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAA2P42765 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms