Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFC5P40937 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFC5P40937 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC5P40937 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC5P40937 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC5P40937 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC5P40937 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC5P40937 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC5P40937 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC5P40937 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC5P40937 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC5P40937 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFC5P40937 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFC5P40937 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFC5P40937 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFC5P40937 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFC5P40937 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFC5P40937 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFC5P40937 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFC5P40937 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFC5P40937 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFC5P40937 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFC5P40937 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFC5P40937 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFC5P40937 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFC5P40937 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFC5P40937 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFC5P40937 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFC5P40937 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFC5P40937 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RFC5P40937 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFC5P40937 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFC5P40937 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFC5P40937 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFC5P40937 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFC5P40937 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFC5P40937 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFC5P40937 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFC5P40937 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC5P40937 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC5P40937 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC5P40937 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC5P40937 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC5P40937 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC5P40937 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC5P40937 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC5P40937 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC5P40937 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC5P40937 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC5P40937 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC5P40937 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC5P40937 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC5P40937 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC5P40937 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC5P40937 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC5P40937 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC5P40937 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms