Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ZEB1P37275 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ZEB1P37275 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
ZEB1P37275 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ZEB1P37275 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ZEB1P37275 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZEB1P37275 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ZEB1P37275 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZEB1P37275 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ZEB1P37275 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ZEB1P37275 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZEB1P37275 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZEB1P37275 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZEB1P37275 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZEB1P37275 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ZEB1P37275 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ZEB1P37275 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ZEB1P37275 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZEB1P37275 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ZEB1P37275 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ZEB1P37275 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZEB1P37275 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
ZEB1P37275 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
ZEB1P37275 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ZEB1P37275 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ZEB1P37275 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZEB1P37275 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ZEB1P37275 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ZEB1P37275 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ZEB1P37275 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ZEB1P37275 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ZEB1P37275 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ZEB1P37275 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZEB1P37275 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms