Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJC1P36383 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJC1P36383 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJC1P36383 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJC1P36383 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJC1P36383 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJC1P36383 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJC1P36383 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJC1P36383 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJC1P36383 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJC1P36383 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJC1P36383 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJC1P36383 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJC1P36383 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJC1P36383 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJC1P36383 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJC1P36383 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GJC1P36383 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJC1P36383 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GJC1P36383 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJC1P36383 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJC1P36383 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJC1P36383 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJC1P36383 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJC1P36383 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJC1P36383 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJC1P36383 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJC1P36383 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJC1P36383 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJC1P36383 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJC1P36383 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJC1P36383 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJC1P36383 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJC1P36383 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJC1P36383 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJC1P36383 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJC1P36383 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJC1P36383 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJC1P36383 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJC1P36383 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJC1P36383 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJC1P36383 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJC1P36383 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJC1P36383 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJC1P36383 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJC1P36383 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJC1P36383 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJC1P36383 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJC1P36383 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms