Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM5P33992 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM5P33992 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM5P33992 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM5P33992 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM5P33992 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM5P33992 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM5P33992 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM5P33992 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM5P33992 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM5P33992 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM5P33992 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM5P33992 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM5P33992 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM5P33992 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM5P33992 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM5P33992 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM5P33992 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM5P33992 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM5P33992 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM5P33992 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM5P33992 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM5P33992 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM5P33992 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM5P33992 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM5P33992 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM5P33992 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM5P33992 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM5P33992 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM5P33992 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCM5P33992 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCM5P33992 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCM5P33992 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM5P33992 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM5P33992 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM5P33992 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM5P33992 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM5P33992 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM5P33992 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM5P33992 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM5P33992 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM5P33992 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM5P33992 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM5P33992 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM5P33992 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM5P33992 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM5P33992 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM5P33992 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM5P33992 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM5P33992 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM5P33992 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM5P33992 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM5P33992 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM5P33992 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM5P33992 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM5P33992 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM5P33992 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM5P33992 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM5P33992 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM5P33992 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM5P33992 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms