Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2E2P29084 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E2P29084 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms