Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms