Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMA1P25786 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms