Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSSP25774 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSSP25774 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSSP25774 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSSP25774 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSSP25774 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSSP25774 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSSP25774 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSSP25774 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSSP25774 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSSP25774 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSSP25774 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSSP25774 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSSP25774 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSSP25774 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSSP25774 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSSP25774 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSSP25774 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSSP25774 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSSP25774 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSSP25774 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSSP25774 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSSP25774 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSSP25774 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSSP25774 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSSP25774 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSSP25774 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSSP25774 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSSP25774 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSSP25774 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSSP25774 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSSP25774 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSSP25774 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSSP25774 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSSP25774 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSSP25774 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSSP25774 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSSP25774 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSSP25774 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSSP25774 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSSP25774 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms