Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP4AP20648 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP4AP20648 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP4AP20648 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP4AP20648 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms