Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM3P20309 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms