Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDGFRAP16234 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFRAP16234 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms