Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAV1P15498 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAV1P15498 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAV1P15498 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAV1P15498 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAV1P15498 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAV1P15498 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAV1P15498 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VAV1P15498 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAV1P15498 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAV1P15498 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAV1P15498 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VAV1P15498 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAV1P15498 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAV1P15498 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAV1P15498 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAV1P15498 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAV1P15498 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAV1P15498 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAV1P15498 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAV1P15498 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAV1P15498 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAV1P15498 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAV1P15498 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAV1P15498 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAV1P15498 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAV1P15498 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAV1P15498 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAV1P15498 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAV1P15498 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAV1P15498 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAV1P15498 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAV1P15498 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAV1P15498 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAV1P15498 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAV1P15498 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAV1P15498 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAV1P15498 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAV1P15498 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAV1P15498 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAV1P15498 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAV1P15498 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAV1P15498 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAV1P15498 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAV1P15498 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAV1P15498 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms