Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH1P12830 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH1P12830 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH1P12830 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH1P12830 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH1P12830 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH1P12830 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH1P12830 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH1P12830 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH1P12830 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH1P12830 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH1P12830 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH1P12830 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH1P12830 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH1P12830 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH1P12830 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH1P12830 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH1P12830 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH1P12830 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH1P12830 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH1P12830 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH1P12830 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH1P12830 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH1P12830 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH1P12830 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH1P12830 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH1P12830 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH1P12830 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH1P12830 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH1P12830 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH1P12830 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms