Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3P09919 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSF3P09919 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSF3P09919 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSF3P09919 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSF3P09919 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSF3P09919 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSF3P09919 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSF3P09919 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSF3P09919 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSF3P09919 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSF3P09919 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSF3P09919 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSF3P09919 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSF3P09919 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSF3P09919 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms